JABATAN AKAUNTAN NEGARA MALAYSIA (JANM) CAWANGAN KENINGAU telah mula mengorak langkah penubuhannya pada tahun 1980. Pada peringkat awal, pejabat ini ditempatkan di sebuah bangunan peninggalan zaman British yang dahulunya merupakan bekas bangunan lama Bendahari Negeri.

Operasi rasmi JANM Cawangan Keningau bermula pada bulan Mei 1980 dengan kekuatan kakitangan seramai 14 orang. Detik bersejarah jabatan ini tercatat pada
1 Jun 1980, apabila cek pertama berjaya dikeluarkan secara rasmi. Seiring dengan keperluan perkhidmatan, pejabat ini telah berpindah ke Pejabat Kelab Belia (berhampiran Bangunan Perpustakaan) pada tahun 1982 dan beroperasi di sana selama satu dekad. Menjelang tahun 1992, JANM Cawangan Keningau sekali lagi berpindah ke Bangunan Rumah Persekutuan dan kekal di lokasi tersebut sehingga kini.

Pertumbuhan jabatan ini dapat dilihat melalui peningkatan tenaga kerja; pertambahan kakitangan kepada 16 orang pada tahun 1992, kini JANM Cawangan Keningau diperkukuhkan dengan seramai 29 orang kakitangan.

Berikut merupakan susur galur kepimpinan yang telah menerajui Jabatan Akauntan Negara Malaysia Cawangan Keningau sejak awal penubuhannya: